水产所技术力量雄厚，拥有100余人的科研技术队伍，中高级以上技术人员占76%，同时还聘请了美国奥本大学、日本东京水产大学、中国海洋大学、中科院发育所、中国水产科学研究院等国内外著名科研机构、大专院校的院士、知名专家、教授为客座研究员。建所以来，共完成国家863、省部级重点科技攻关、推广等项目200余项，取得了100多项科技成果，其中“北京市郊区池塘养鱼高产技术大面积综合实验”、“以鲢鳙鱼为主稳产高产综合技术的研究”、“西伯利亚鲟鱼人工繁殖及商品鱼养殖配套技术研究”等56项科研成果获得了科技部、农业部和市政府的科技奖。为解决首都“吃鱼难”的问题做出了重要贡献，为保障北京水产食品安全发挥了重要作用，对本市乃至全国渔业行业科技进步及渔业质量和效益的提高起到了重要推动作用。